Sebagai mantan pemain Inter Milan, Nagatomo juga memiliki hubungan dengan Ketua Umum PSSI Erick Thohir.
Erick Thohir dulu pernah menjadi pemilik klub Seri A tersebut dalam periode Nagatomo bermain.
“Saya tidak sering menghubunginya. Tapi saya tahu melalui Instagram. Saya melihat unggahannya.
Saya merasa kami selalu terhubung. Dia orang yang sangat baik dan ramah sejak kami bersama di Inter Milan. Saya tidak sabar bertemu dengannya,” pungkas Nagatomo.